Проанализировано современное состояние исторической науки в контексте применения методов, выработанных в рамках естественных наук, в частности системного подхода и синергетики. Рассмотрены основные точки зрения по данной проблеме, выраженные в работах российских и казахстанских авторов, перспективы дальнейшего развития междисциплинарных исследований. Сделан вывод о трансформации самих этих подходов в рамках гуманитарного исследования.