В компьютерном эксперименте исследован атомный порядок в продуктах парофразного криогенного синтеза систем "переходный металл - бензол". Рассчитана кинетика атомного упорядочения в модели квазиодномерных нанометровых молекулярных "стопок" при температуре Т = 300 К. Расчет проведен на основе неэмпирических межчастичных потенциалов, полученных методом функционала плотности. Показано возникновение квадиодномерного упорядочения по типу "сэндвичей" в Сr-Вr, слабого расслоения в Rh-Вz и сильного расслоения с возникновением атомных кластеров в Ru-Вz.